introgression

par clarée Mer 4 Mar 2015 - 9:22

En admettant que nos analyses génétiques soient justes ce dont je doute , savez vous ce que signifie 5 pour cent d'introgression?
Perso je comprends cela comme une moyenne mais est-ce homogène ou y a t-il de grosses différences entre les truites, bon on enlève évidemment les éventuelles bassines et poissons d'alevinage du lot étudié

par leny Mer 4 Mar 2015 - 11:22

Si c'est 5% d'introgression d'atl vers med cela veut dire que l'individu étudié a un génome constitué a 95% med et 5% atl

apres avoir etudier plusieurs individus, tu peux faire des statistiques descriptives de ta population et dire par exemple que le taux moyen d'introgression de ta population est de 5%.

savoir si c'est un resultat sur un individu ou une population? faut voir si y'a le mot moyenne, médiane, ou autre élément de statistique descriptive et que l'auteur parle de population. tu peux voir ces infos dans la partie materiel et methode de la publication scientifique.
savoir si cette moyenne est representative (cad si il n'y a pas trop de valeurs extremes), tu peux regarder des elements qui expliquent la variation dans ta population comme l'ecartype, la variance, le coefficient de variation...

de la a mettre en doute des analyses génétiques... c'est tres fiable comme methode super

ce qui peut etre discutable c'est la partie statistique avec le choix des indicateurs, les verification d'homogeinité des valeurs de references par des tests...

par Castor 1er de la Castille Mer 4 Mar 2015 - 11:48

Introgression , c'est un synonyme d’intromission, c'est un acte grossier suivant comme il est employé introgression 271131

par tangaraf Mer 4 Mar 2015 - 12:23

donc faut lire les rapports en plein et ne pas se fier uniquement au résultat statistiques et leurs explication (c'est un peu comme le taux de chômage français!)...

Le plus dur; c'est de trouver ces rapports entiers.. d'ailleurs si quelqu'un à quelques choses sur un quart sud est français (Rhones Alpes et PACA) , je suis preneur... study

par Geoffrey73 Mer 4 Mar 2015 - 13:37

En ce qui concernent la seule étude que j’ai lu complètement (ce qui prend énormément de temps, en recherche de définition de termes technique, pour un non-initié), les tech de la fédé avaient découpé la rivière en tronçon selon la disposition des seuils infranchissables ou difficilement.
Dans ces tronçons, ils avaient menés leurs analyses sur 10 poissons capturés (quand il y en avait 10) et avaient fait une moyenne par tronçon. Par contre le détail de chaque individu était porté au document.

Pour mesurer le taux d’introgression, ils se sont basés sur 2 marqueurs de 2 individus cibles types (donc théoriquement pure à 100%), 1 Med et 1 Atl, qu’ils ont comparé au mêmes 2 marqueurs d’un individu cible contacté, la différence entre le nombre de gênes des 2 séquences donne le taux d’introgression.

C’est très enrichissant ce genre d’étude et lorsqu’elles sont bien rédigés, ça entre-ouvre la porte de la curiosité, qui permet d’aller chercher les infos pour en apprendre encore d’avantage. En tout cas ça m’a permit de comprendre pas mal de chose.

Pour faire un pont avec un autre topic du forum, celui sur les souches de truites. C’est grâce à cette étude et surtout les recherches qui ont suivis, que j’ai compris pourquoi il ne fallait pas se baser sur la robe des poissons pour déterminer leurs appartenances au rameau Med ou Atl, la différence entre hybridation et introgression, etc…

Le lien vers l’étude:
http://www.documentation.eaufrance.fr/entrepotsOAI/AERMC/R84/15.pdf

par Castor 1er de la Castille Mer 4 Mar 2015 - 14:10

Pour faire un pont avec un autre topic du forum, celui sur les souches de truites. C’est grâce à cette étude et surtout les recherches qui ont suivis, que j’ai compris pourquoi il ne fallait pas se baser sur la robe des poissons pour déterminer leurs appartenances au rameau Med ou Atl, la différence entre hybridation et introgression, etc…

Ben , c'est compliqué . Tien , une truite du Cernon . Méditerranéenne a première vue (certainement pisciculture ) , alors que le Cernon ce jette dans le tarn , le tarn dans la Garonne , et la garonne dans l'Atlantique . Donc une belle truite certes , mais illusoires . Un coup a "Mandrake" $Je m\'interroge$
[img] introgression Truite10

[/img]

par el gringo Mer 4 Mar 2015 - 14:27

je vois pas ce qu'elle aurait de Med cette truite, les grosses ATL en vieillissants perdent les points rouges aussi...

par Castor 1er de la Castille Mer 4 Mar 2015 - 14:43

el gringo a écrit:je vois pas ce qu'elle aurait de Med cette truite, les grosses ATL en vieillissants perdent les points rouges aussi...

Ah bon ? ben c'est ce que j'ai aperçu dans la rivière pardi ! Sur le moment , j'ai crus des confettis introgression Confettis-rouge-rond-papier

Merci qui , merci El Gringo large sourire 1

par el gringo Mer 4 Mar 2015 - 15:04

je crois qu'a force de lire des trucs à droite à gauche plus le fait que s'il faut on se base sur du vent pour les études de génétique, tout cela fait qu'on ne saura plus vraiment.

par el gringo Mer 4 Mar 2015 - 15:41

Castor 1er de la Castille a écrit:
el gringo a écrit:j
Ah bon ? ben c'est ce que j'ai aperçu dans la rivière pardi ! Sur le moment , j'ai crus des confettis
Merci qui , merci El Gringo

on a du faire la même riviére:

par **dede** Mer 4 Mar 2015 - 15:53

Castor 1er de la Castille a écrit:

Pour faire un pont avec un autre topic du forum, celui sur les souches de truites. C’est grâce à cette étude et surtout les recherches qui ont suivis, que j’ai compris pourquoi il ne fallait pas se baser sur la robe des poissons pour déterminer leurs appartenances au rameau Med ou Atl, la différence entre hybridation et introgression, etc…

Ben , c'est compliqué . Tien , une truite du Cernon . Méditerranéenne a première vue (certainement pisciculture ) , alors que le Cernon ce jette dans le tarn , le tarn dans la Garonne , et la garonne dans l'Atlantique . Donc une belle truite certes , mais illusoires . Un coup a "Mandrake" $Je m\'interroge$
" />

c'est de ALT pure celle ci introgression 269558

par Castor 1er de la Castille Mer 4 Mar 2015 - 18:37

Pour tout te dire Dédé , je vais faire des prélèvements d'ADN large sourire 1

Tien , si tu as dutemps a tuer , je t’envoie de quoi lire super

.
http://www.lifemacrostigma.org/sites/g/files/g1035261/f/201304/Etude_ADN_mitochondrial_2010.pdf
Bon courage introgression 271131

par lamicheric Mer 4 Mar 2015 - 18:38

dede a écrit:
Castor 1er de la Castille a écrit:

Pour faire un pont avec un autre topic du forum, celui sur les souches de truites. C’est grâce à cette étude et surtout les recherches qui ont suivis, que j’ai compris pourquoi il ne fallait pas se baser sur la robe des poissons pour déterminer leurs appartenances au rameau Med ou Atl, la différence entre hybridation et introgression, etc…

Ben , c'est compliqué . Tien , une truite du Cernon . Méditerranéenne a première vue (certainement pisciculture ) , alors que le Cernon ce jette dans le tarn , le tarn dans la Garonne , et la garonne dans l'Atlantique . Donc une belle truite certes , mais illusoires . Un coup a "Mandrake" $Je m\'interroge$
" />

c'est de ALT pure celle ci

Pure je sais pas, mais on a les mêmes chez nous... et des truites avec des bandes sombres comme les med aussi alors....

par Castor 1er de la Castille Mer 4 Mar 2015 - 18:58

[quote="lamicheric"][quote="dede"]

Castor 1er de la Castille a écrit:

Pure je sais pas, mais on a les mêmes chez nous... et des truites avec des bandes sombres comme les med aussi alors....

Ben sur que vous avez les mêmes chez vous , elles viennent du même endroit , une pisciculture certainement . Certaines études disent que la souche autochtones reprend le dessus sur les truites de remises , mais il faut appeler un chat un chat . Si tu mélange du lait et du café , tu as du café au lait . et pour avoir du lait ou du café , il te faudra ajouter des dizaines de litres de l'un ou de l'autre pour que la couleur blanche ou café reprennent le dessus , mais ce seras illusoire car le mélange de base existeras toujours par rapport a du café ou du lait pur au départ . C'est imagé , mais c'est ce qui se passe pour les truites . On n'auras jamais plus une souche pure la ou il y a eu des mélanges de souches ou de races . Puis en fait cela change quoi si la 5 eme générations est né dans la rivière et que tout en étant de belles truites , elles ne soit pas de souches pure du moment qu'elle nous a donné du plaisir a la prendre ? super

par **dede** Mer 4 Mar 2015 - 19:41

bon pure je sais pas introgression 271131

mais ce n'est pas une med ça c'est sur

par Castor 1er de la Castille Mer 4 Mar 2015 - 20:04

Pas sur , peut être pas pure ,mais elle a les trois zébrures + aucun point rouges . Par contre les points sont auréolés .Donc n'étant pas un savant , je me base sur certains points comme les zébrures , les points , la forme de la truite . Je donne ma langue au chat (pas la truite ) large sourire 1

par HautVerdon Mer 4 Mar 2015 - 20:21

Ca c'est un vraie med

Une vraie :

par **MARAUD** Mer 4 Mar 2015 - 20:44

ouais d'espagne !mal ébarbée! introgression 42961

par el gringo Mer 4 Mar 2015 - 20:56

une macro touffa !

par **dom'ain** Mer 4 Mar 2015 - 22:08

MARAUD a écrit:ouais d'espagne !mal ébarbée!

moi je dirais plutôt a l'ouest de l’Espagne introgression 269558

par **dede** Mer 4 Mar 2015 - 22:21

je dirai plutôt a l'ouest du continent ibérique introgression 271131

par **dede** Mer 4 Mar 2015 - 22:22

dom'ain a écrit:
MARAUD a écrit:ouais d'espagne !mal ébarbée!
moi je dirais plutôt a l'ouest de l’Espagne

ha merde on a eu la même idée j'avais pas vu Razz

par lamicheric Mer 4 Mar 2015 - 22:34

No catch pour moi, trop encombré comme milieu Shocked

par el gringo Mer 4 Mar 2015 - 23:12

c'est le farnat complet tu peux l'avoir à fil intérieur si c'est trop court ça passe pas.

par **toctoctoc60** Jeu 5 Mar 2015 - 7:11

Une vache n'y retrouverai pas son veau ! large sourire 1

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