Au cœur de la Bourgogne existe un endroit où la goutte de pluie,selon qu'elle tombe ici ou trois mètres plus loin, s'en va rejoindre la Manche, l'Atlantique ou bien encore la Méditerranée, après avoir grossi soit l'Yonne puis la Seine, soit la Loire, soit la Saône puis le Rhône. C'est la ligne de partage des eaux.

C'est donc cette ligne de partage des eaux et les différents bassins versants qui déterminent la souche des truites, soit de type Atlantique soit de type méditerranéen.
En Pyrénées, les deux souches sont présentes.
ATL pour les Pyrénées-Atlantiques, Hautes-Pyrénées, Haute-Garonne,Ariège.
MED pour l’Ariège, l’Aude, Pyrénées-Orientales.
Remarquer que seul, l’Ariège, possède les deux souches.
En ce qui concerne les Alpes françaises, seule la souche Med devrait être présente en théorie.
Le massif central,tout comme les Pyrénées, possède les deux souches.

Quelques indications visuelles permettent de faire le distinguo entre une truite de type Atlantique et une truite de type Méditerranéenne, seulement, seul une étude génétique permet d'affirmer de façon sure la souche.

Reprenons les deux type de truite présentées en début de page :

Quelques critères de reconnaissances externes pour une évaluation de la souche

MED:

a: marque de parr visibles sur la hauteur du corps.
b: pas de frange blanche sur la nageoire anale
c: ligne latérale peu visible, ou même invisible
d:les points sont petits , de couleur rouge et/ou noir, et de forme irrégulière
e: le nombre de points sur l'opercule est au moins supérieur à 8, bien souvent même supérieur a 16
f: Un point noire est toujours présent sur le préopercule

ATL:

a: marque de parr plus courte et plus ronde
b: une frange blanche borde la partie inférieur de la nageoire anale
c: la ligne latérale est bien visible et coupe bien souvent des points rouge ocellés de blanc
d: gros points rouges ou noirs cerclés de blanc
e: généralement 5 ou 6 points sur l'opercule
f: présence aléatoire du point noire sur le préopercule

L'introduction de truite de souche différente que celle présente à l'origine conduit à des hybridages divers et variés, la souche Med ayant très fortement subit l'alevinage massif de truites Danoise...